Estudio in Silico de la Proteína VP8 de Rotavirus y su Interacción con Superficies de Sílica Amorfa

Abstract

En este trabajo, se presenta una aproximación a un estudio computacional de las principales características moleculares responsables del mecanismo de asociación del fragmento viral VP8 del Rotavirus (Alvareda et al., Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, 37:18–19, 2019), responsable de la adsorción de este virus simulando un sistema natural suelo-agua y su interacción con una superficie de sílica amorfa en solución acuosa, mediante técnicas de dinámica molecular a nivel atómico con solvente explícito. Se determinó el potencial de fuerza media (Darve et al., Molecular Simulation, 28(1-2):113–144, 2002) requerido para la desorción del fragmento VP8 de la superficie de sílica amorfa, las energías de interacción involucradas entre el fragmento VP8, la superficie y el solvente y, se identificaron las interacciones moleculares más relevantes del fragmento VP8 responsables de la afinidad entre el Rotavirus y la superficie de sílica.